Les témoignages de la Vie de Plotin, de Porphyre, fournissent le cadre historique de la philosophie d'Ammonius. La première rencontre fait apparaître le penseur alexandrin à la remarquable personnalité; la visite d'Origène révèle un secret encombrant; tandis que le §20 présente enfin Ammonius comme quelqu'un qui faisait progresser dans la réflexion. Le témoignage d'Ammien Marcellin, sur Saccas, paraît plus crédible que celui de Théodoret, philologique- ment faux, que la Souda n'a fait que reprendre. C'est avec Némésius qu'apparaît la force de la pensée ammonienne sur l'âme qui reste inchangée, malgré son union, faisant de l'homme cet être à part; Priscien allait dans ce sens; et aucune confusion n'en résulte avec Plotin. Avec Photius, Ammonius apparaît comme celui qui a pris conscience, a simplifié la philosophie, en faisant d'elle cet arbre aux branches émondées, et avec l'Un, l'Intelligence et l'Âme, a impulsé les deux directions du néoplatonisme: celle de Plotin et celle de Proclus. Avec Photius encore (461a), on peut présumer que l'enseignement d'Ammonius était celui d'une méthode unissant Platon aux apories d'Aristote et à leurs résolutions, qui formera l'ossature des traités de Plotin.