Le problème de l'individu se pose chez Aristote à la conjonction des deux grandes interrogations de la pensée grecque: le changement substantiel et l'intelligibilité du monde. Il est techniquement résolu à l'intérieur du cadre hylémorphique de la composition des substances. Par ailleurs, les concepts métaphysiques du Stagirite sous- tendent partiellement l'étude du cosmos et celle des êtres vivants. Cet article montre que le penseur athénien n'a pas toujours su passer légitimement d'un de ces registres de pensée à l'autre. Il en est résulté l'apparition d'apories dans sa doctrine de l'individuation des substances, et cela sur les trois plans de la métaphysique, de la biologie et de la cosmologie.